يعمل المركز المصري للتحكيم وفق مجموعة من القواعد والضوابط التي تكفل حسن سير العمل وترسيخ عوامل الكفاءة والأمانة اللازمين لأداء مهامه. وذلك وفقاً للأحكام المنصوص عليها بالنظام الأساسي مع العمل على توظيف التكنولوجيا في شتى أعمال ومهام المركز.