يعد النظام الأساسي للمركز الالية التي تنظم إجراءات التحكيم والوساطة وتسوية المنازعات وفقا للمركز المصري للتحكيم الاختياري وتسوية المنازعات غير المصرفية. وبناءً عليه تصبح قواعد النظام الأساسي للمركز هي القواعد الحاكمة والمطبقة للمسائل الإجرائية للتحكيم والوساطة وكافة طرق فض المنازعات، بالنسبة للمنازعات التي تحال لتسويتها بواسطة المركز
تم إصدار النظام الأساسي للمركز المصري للتحكيم الاختياري وتسوية المنازعات المالية غير المصرفية بقرار السيد الدكتور/ رئيس مجلس الوزراء مصطفى مدبولي، رقم (2597 لسنة 2020). بالإضافة إلى تحديد القواعد المنظمة لعمل المركز.
